Bakalářský projekt (bc-INF) v programu, specializaci Informatika - počítačové vědy.
Kontext: vyvinuli jsme software, který vezme OpenSim muskuloskeletální model a příslušné dostupné 3D modely svalů a úponových oblastí a následně dokáže simulovat deformaci těchto svalů v reakci na pohyb kostí. Takovéto simulace jsou vhodné pro posouzení zátěže kostí a lze je použít např. pro prevenci/predikci zlomenin, ve sportovní medicíně, ... V praxi ale pro konkrétního pacienta nemáme 3D modely, natož pak OpenSim muskuloskeletální model, ale pouze CT/MRI snímky (obrázky).
Cíle práce je implementace automatické pipeline, která na základě MRI snímků připraví model vhodný pro náš simulátor. Tato pipeline využije TotalSegmentator (https://github.com/wasserth/TotalSegmentator?tab=readme-ov-file), metodu hlubokého učení, pro segmentaci CT/MRI dat, po extrakci 3D struktur pak použije nástroj STAPLE pro vytvoření OpenSim modelu. Pipeline bude ověřena na datech LHDL a dále pak na dalších minimálně dvou dalších datasetech a výsledky následné simulace budou porovnány mezi sebou a s těmi, které jsou publikovány.
Téma vypsal: Doc. Ing. Josef Kohout, Ph.D. (UN 338)
Vypsáno pro akademický rok 2025/2026 dne: 2025-05-13
Toto téma je zatím volné. Pokud o téma máte vážný zájem, vyplňte prosím následující formulář, kterým si téma zamluvíte (všechny položky jsou povinné).